En nuestro recorrido, no ha sido menos importante la incorporación de plantas propias de las lagunas existentes en la zona, habiendo visitado los complejos lagunares de Pedro Muñoz, Alcázar de San Juan y algunas poblaciones de Cuenca, como la Laguna del Hito e, indudablemente, las Lagunas de Ruidera y Las Tablas de Daimiel, así como también hemos recorrido al Pantano de Peñarroya y el Embalse del Puerto de Vallehermoso.
Asimismo, aunque fuera de la comarca, hemos pasado a ver algunas dolinas y uvalas, así como lagunas aisladas de tipo endorreico.
En ellas, hemos realizado un estudio para un conjunto de flora específica, derivada especialmente del movimiento del agua en las zonas de aportes de los ríos y zonas encharcadas y las especies que predominan en aguas estancadas, donde los aportes proceden principalmente de las aguas de lluvia.
La importancia de la flora existente, permite poder encontrar algunas especies poco extendidas y muy específicas, así como algiuna autóctona y adaptada como ocurre en Las Lagunas de Ruidera.
Estas zonas permiten traer la atracción y cria de aves migratorias que embellecen durante una época estas lagunas con sus bellos colores y plumaje.
